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乳酸化“作祟”?科学家发现复发性流产新机制与关键靶点!

发布时间:  2025-12-10 07:35:32

复发性流产(RSA),一个困扰无数家庭的难题,其背后病因错综复杂,如同一个难解的谜团。传统研究多聚焦于免疫或内分泌因素,然而,中国医科大学团队近期在《International Journal of Biological Macro molecules》(IF=8.5)上发表的最新研究,却将目光投向了近年来生命科学领域的热点——“蛋白质乳酸化”修饰。

这项研究巧妙地将单细胞测序、机器学习与功能实验相结合,不仅首次在RSA中系统绘制了乳酸化修饰的基因图谱,鉴定出4个核心枢纽基因,还将乳酸代谢、免疫紊乱与滋养细胞功能障碍紧密串联起来,揭示了从“乳酸”到“流产”的关键致病通路。这究竟是怎样一个过程?又为何能为未来的精准诊疗带来新希望?让我们一同解读。


题目:发现与蛋白质乳酸化相关的生物标志物及其在复发性流产中的潜在致病机制

杂志:Int J Biol Macromol

影响因子:IF=8.5

发表时间:2025.09


研究背景

RSA指连续发生两次及以上妊娠丢失,影响1–2%的育龄女性,其病因复杂,涉及遗传、免疫、内分泌等多因素交互作用。现有研究虽明确免疫调节与滋养细胞功能障碍在RSA中具有关键作用,但具体分子机制尚未完全阐明。近年来,乳酸化作为一种新型蛋白质翻译后修饰,在代谢与免疫调控中展现出重要作用,然而其在RSA中的功能与机制仍属未知。本研究旨在探索乳酸化修饰在RSA发生发展中的潜在作用,以填补该领域的研究空白。


研究思路

整合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,结合乳酸化相关基因集,运用多种机器学习方法筛选关键乳酸化相关基因;通过免疫浸润分析与分子分型揭示其与免疫微环境的关系;进一步通过体外实验验证核心基因S100A11在调节滋养细胞功能及抗炎反应中的机制。


数据来源

使用GEO数据库中的scRNA-seq数据集GSE214607(3例RSA,5例正常蜕膜)和bulk RNA-seq数据集GSE26787(5例RSA,5例对照)与GSE165004(24例RSA,24例对照)。


主要结果

1、单细胞转录组图谱揭示RSA中代谢-免疫协同失调的微观环境

通过对GSE214607数据集的深度分析,研究发现RSA样本中存在跨细胞类型的协同功能失调。在38498个高质量细胞中,巨噬细胞和单核细胞表现出先天免疫通路的显著激活;T细胞和NK细胞则显示PD-1信号通路上调,提示T细胞耗竭状态;而成纤维细胞和上皮细胞中,ECM-受体相互作用、粘着斑等组织重塑通路异常活跃。GSVA分析进一步显示,氧化磷酸化、活性氧物种、脂肪酸代谢等代谢通路在多个细胞类型中紊乱。




2、乳酸化相关差异表达基因的系统筛选与枢纽基因鉴定

研究团队首先从文献中收集了336个乳酸化相关基因,然后将其与批量RNA-seq(GSE26787和GSE165004)和单细胞RNA-seq(GSE214607)鉴定出的差异表达基因取交集。这一策略成功筛选出2个上调(S100A11、HMGN3)和5个下调(PTMA、HNRNPU、TPM4、MSN、CALD1)的乳酸化相关差异表达基因。为进一步精炼候选标志物,研究采用了包括Lasso、Ridge、随机森林、XGBoost等在内的105种机器学习算法组合进行筛选。最终随机森林模型(平均AUC=0.92)表现最优,确定了4个乳酸化枢纽基因:HNRNPU、PTMA、CALD1和S100A11。



3、单基因GSEA揭示枢纽基因的生物学功能特征

通过基因集富集分析发现每个枢纽基因都参与不同的生物学过程。CALD1主要富集于免疫系统、细胞因子信号和中性粒细胞脱颗粒通路。HNRNPU在L13a介导的翻译沉默和SLIT/ROBO信号调节中富集。PTMA显著富集于细胞周期和有丝分裂细胞周期通路。S100A11则同时与细胞周期、蛋白质翻译、RNA代谢和炎症反应等多个通路相关,体现了其在RSA中的多效性作用。


4、转录因子调控网络的构建与上游调控机制解析

利用RegNetwork数据库,研究构建了4个枢纽基因的上游调控网络。结果显示S100A11受到TFAP2A、TFAP2C和XBP1等转录因子的调控,这些因子在胚胎发育和免疫调节中发挥重要作用。同时,多个miRNA被鉴定为枢纽基因的潜在调控因子。这一复杂的转录因子-miRNA-枢纽基因调控网络,从表观遗传层面解释了乳酸化相关基因在RSA中的失调机制。


5、枢纽基因指导下的免疫微环境解析与分子分型

基于4个枢纽基因的表达谱,研究对RSA样本进行了深入的免疫浸润分析和分子分型。ssGSEA分析显示RSA中免疫细胞组成显著失衡:与免疫调节相关的细胞丰度下降,而促炎性的单核细胞显著增加,表明母胎免疫耐受机制受损。更重要的是,共识聚类分析根据枢纽基因表达将RSA患者清晰地分为两个分子亚型:Cluster A富集于细胞周期、DNA复制、错配修复等基础细胞功能通路,提示可能存在遗传或发育缺陷;Cluster B则富集于免疫应答、感染(如幽门螺杆菌感染)及代谢紊乱相关通路,体现了免疫代谢异常驱动的病理特征。这种基于乳酸化相关基因的分子分型,为理解RSA异质性提供了新视角。



6、乳酸-S100A11轴的功能机制验证

体外功能实验证实,乳酸处理能显著上调S100A11表达和蛋白质乳酸化水平。机制研究表明,S100A11通过激活p38 MAPK-TGF-β1-SMAD信号轴,促进抗炎因子IL-10和TGF-β的表达,同时抑制滋养细胞的增殖和侵袭能力。当使用p38抑制剂SB203580(10μM)或TGF-β1中和抗体处理时,该信号通路被有效阻断,证实了S100A11作用的具体机制。



文章小结

本研究系统揭示了乳酸化修饰在RSA发病机制中的关键作用,识别出四个乳酸化相关枢纽基因并构建其与免疫微环境紊乱的关联。S100A11作为核心效应分子,通过p38 MAPK–TGF-β1–SMAD–IL-10信号轴调控滋养细胞功能与局部免疫耐受,表明乳酸介导的代谢重编程在RSA进程中具有重要作用。该研究为理解RSA的分子机制提供了新视角,并为未来靶向治疗与患者分型提供了潜在标志物与干预靶点。





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