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昼夜节律基因与高血压的遗传关联:一项双样本孟德尔随机化研究

发布时间:  2026-08-25 14:42:57

2026年8月11日,Wang等在线发表题为《Genetic evidence linking circadian rhythm genes and hypertension:A two-sample Mendelian randomization study》的研究。该研究采用双样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法,评估昼夜节律相关基因与高血压风险之间的潜在遗传关联。



摘要

昼夜节律参与调控多种人体生理功能。既往观察性研究提示,昼夜节律紊乱可能与高血压发生有关,但传统研究容易受到混杂因素和反向因果影响,因此难以判断二者之间是否存在因果关系。

本研究利用非重叠欧洲血统人群的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)汇总数据,开展双样本MR分析。暴露因素为Circadian Gene DataBase(CGDB)中收录的1276个昼夜节律相关基因,结局为UK Biobank来源的高血压GWAS数据,共包含463010名参与者,其中54358例为高血压病例,408652例为对照。

研究以逆方差加权法(inverse variance weighting,IVW)作为主要分析方法,并采用Benjamini-Hochberg错误发现率(false discovery rate,FDR)校正处理多重检验问题。敏感性分析包括异质性检验、MR-Egger回归、MR-PRESSO分析、Steiger方向性检验和逐一剔除分析。

结果显示,IVW分析共发现39个昼夜节律相关基因与高血压存在名义显著关联。经FDR校正后,4个基因仍具有统计学意义,分别为PHOSPHO1、BAIAP3、OSGIN2和ZDHHC18。其中,PHOSPHO1和OSGIN2与较低高血压风险相关,而BAIAP3和ZDHHC18与较高高血压风险相关。

功能富集分析显示,这些关联基因主要涉及昼夜节律、细胞凋亡和糖胺聚糖生物合成等通路。敏感性分析未发现明显异质性或水平多效性。


结果

研究首先从昼夜节律基因相关GWAS数据中筛选工具变量。经过全基因组显著性筛选(P<5×10⁻⁸)、连锁不平衡筛选、F统计量筛选和混杂因素排除后,共保留3174个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为工具变量。

这些工具变量的平均F统计量为276.5,范围为29.7~14552.9,均大于10,提示弱工具变量偏倚的可能性较低。其中,1864个SNP位于目标基因上下游±1Mb范围内,属于顺式作用变异,占58.7%;其余1310个为反式作用变异,占41.3%。

双样本MR核心分析显示,在1276个昼夜节律相关基因中,共有39个基因与高血压风险存在名义显著关联(IVW,P<0.05)。其中,18个基因的比值比(odds ratio,OR)大于1,提示其遗传变异可能与高血压风险升高相关;其余基因则表现为保护性关联。

经过FDR校正后,有4个基因达到统计学显著水平,作为本研究的主要结果。

PHOSPHO1显示最显著的保护性关联。IVW结果显示,PHOSPHO1与高血压风险降低相关,β=-0.0122,标准误为0.0027,P=4.97×10⁻⁶,FDR校正后P=0.0031,OR=0.988,95%置信区间(confidence interval,CI)为0.983~0.993。

OSGIN2同样与高血压风险降低相关,β=-0.0096,标准误为0.0023,P=2.97×10⁻⁵,FDR校正后P=0.0046,OR=0.990,95%CI为0.986~0.995。

相反,BAIAP3与高血压风险升高相关,β=0.0092,标准误为0.0022,P=2.45×10⁻⁵,FDR校正后P=0.0046,OR=1.009,95%CI为1.005~1.014。

ZDHHC18也表现为风险增加关联,β=0.0120,标准误为0.0028,P=1.58×10⁻⁵,FDR校正后P=0.0046,OR=1.012,95%CI为1.007~1.018。

除这4个基因外,其他35个名义显著基因未通过FDR校正,因此仅作为探索性结果。其中包括部分核心生物钟基因,如PER2和CRY2。PER2与高血压风险升高相关,而CRY2表现为保护性关联,但这些结果未达到多重检验校正后的显著性标准。

敏感性分析显示,Cochran Q检验未发现明显异质性。MR-Egger截距检验显示,各基因的截距均未显著偏离0,提示未发现明显方向性水平多效性。对于符合SNP数量要求的基因,MR-PRESSO分析未发现显著异常SNP。Steiger方向性检验支持昼夜节律相关遗传变异影响高血压风险的方向,而非反向作用。逐一剔除分析显示,单个SNP的排除未明显改变总体结果,提示主要结果较为稳定。

功能富集分析显示,名义显著关联基因主要富集于昼夜节律通路、昼夜节律同步、细胞凋亡、辅因子生物合成以及糖胺聚糖生物合成等通路。Gene Ontology(GO)分析进一步显示,这些基因主要参与昼夜节律负调控、基因表达的昼夜节律调控、神经递质转运调节和代谢过程等生物学功能。


研究方法

本研究采用双样本MR设计,探索昼夜节律相关基因与高血压风险之间的潜在关联。整体流程包括数据获取与处理、工具变量筛选与验证、MR效应估计以及功能富集分析。

昼夜节律相关基因集来自CGDB数据库,共包括1276个基因。高血压GWAS数据来自MRC Integrative Epidemiology Unit(IEU)OpenGWAS数据库,数据集编号为ieu-b-5144,研究对象均为欧洲血统人群。暴露样本和结局样本无重叠,能够降低样本重叠偏倚。

工具变量筛选遵循MR三项基本假设。第一,SNP需与昼夜节律相关基因显著相关,筛选阈值为P<5×10⁻⁸;第二,SNP之间需相互独立,因此采用r²<0.001、距离大于10000kb的标准进行连锁不平衡筛选;第三,工具变量不应与高血压相关混杂因素显著相关,研究通过GWAS Catalog和PhenoScanner数据库排除与潜在混杂因素相关的SNP。

需要注意的是,本研究的SNP是基于昼夜节律基因区域及相关GWAS数据筛选,而不完全等同于经过实验验证的顺式表达数量性状位点。因此,结果更准确地说是昼夜节律基因区域遗传变异与高血压风险之间的MR估计关联,而不能直接解释为基因表达水平本身对高血压的作用。

MR分析以IVW为主要方法,同时采用MR-Egger、加权中位数法、简单众数法和加权众数法作为补充验证。阳性结果需满足IVW分析P<0.05、至少3种补充方法方向一致、敏感性分析未提示显著异质性或多效性,以及逐一剔除分析结果稳定。

由于同时检测1276个基因,研究采用Benjamini-Hochberg FDR方法进行多重检验校正,以FDR校正后P<0.05作为主要显著性标准。所有统计分析使用R4.2.0和TwoSampleMR0.6.14完成,功能富集分析使用clusterProfiler和ggplot2完成。


小结

本研究利用双样本MR方法,分析了1276个昼夜节律相关基因与高血压风险之间的遗传关联。结果发现39个基因具有名义显著关联,其中PHOSPHO1、BAIAP3、OSGIN2和ZDHHC18在FDR校正后仍具有统计学意义。

PHOSPHO1和OSGIN2可能与较低高血压风险相关,BAIAP3和ZDHHC18则可能与较高高血压风险相关。敏感性分析未发现明显异质性、水平多效性或反向因果证据。

功能富集结果提示,昼夜节律调控、细胞凋亡和糖胺聚糖生物合成等过程可能参与血压调节。总体而言,本研究为昼夜节律基因与高血压风险之间的关系提供了遗传学证据,但相关发现仍属于假设生成性质,尤其是未通过FDR校正的名义显著结果,需要进一步实验验证。




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